Для начала работы в системе необходимо добавить семантическое ядро в разделе Видимость → Загрузка → Новое задание.

Формат добавления семантического ядра
Семантическое ядро задается в виде списка запросов, документов (страниц), которые должны быть в выдаче по этим запросам, и категорий документов (страниц).
В категории стоит указывать бизнес-направления, т.е. разделы, которые скорее всего не будут изменяться. Обычно у одного проекта до 20-30 категорий.
Пример добавления одного запроса:
телевизор LG ; http://magazin.ru/tv/lg; телевизоры
Добавлять данные можно как через загрузку файла (в формате CSV/XLSX/ODS), так и через интерфейс в виде списка.

Если к примеру нет посадочных урлов на запросы, то нужно использовать тип только запросы
Достаточно просто указать запросы, которые хотите загрузить в систему и указать категорию, в которую попадут эти запросы.

Как работает этот метод:
В первую очередь платформа ищет запрос в первых 100 результатах выдачи.
Если его там не нашлось, то делается поиск по сайту (запрос site:mysite.ru).
В случае, если его нет и там, то используется главная страница сайта.
Статус заданий
После добавления данных можно отследить статус их выполнения. Во вкладке Загрузка файлов отображается история по всем загруженным файлам и заданиям выполненным через интерфейс. Если выбрать настройки задания, то можно скачать оригинал задания или список ошибок (если они были допущены).

Логика работы с запросами, документами, категориями
В системе заложена следующая логика:
— Запрос принадлежит только одному документу (странице), а документ (страница) принадлежит только одной категории. Например, если у документа (страницы) 2 запроса и для одного из них мы поменяем категорию, то автоматически изменим категорию и для второго запроса.

Если мы у запроса «Телевизор купить» (точнее у соответствующего Документа (страницы) поменяем категорию на «Техника для дома» , то у запроса «Телевизор LG» тоже поменяется категория (т.к. документы (страницы) одинаковые).
Более подробно описано в статье Логика работы с семантическим ядром
Группировка запросов и документов
— В отличие от категорий, документы (страницы) могут принадлежать какому угодно количеству Групп (здесь более подробно о Группах)
— Для группировки по запросам используются Выборки запросов, они работают аналогично Группам страниц, т.е. их можно добавлять сколько угодно для любых запросов (здесь более подробно о Выборках)
— В разделе загрузки можно добавлять и другие задания.

Для каждого типа задания указан необходимый формат таблицы. Все задания возможно выполнить так же и через интерфейс.
В статье Создание групп и выборок, изменение документов (страниц) и категорий показано как можно выполнять эти задания в интерфейсе.